Dansk forskning i isIam har gennemgående været for fokuseret på at forsvare og forklare isIam frem for at kaste et kritisk blik på de mere mørke sider i religionen.
Det mener nogle isIamforskere, som peger på, at det har fået konsekvenser for integrationen og for politikernes muligheder for at handle og gribe ind over for parallelsamfund.